חברת Caris בודקת את רצף ה – DNA של כלל הגנים בתאי הגידול – למעלה מ – 22,000 גנים, בשיטה הנקראת Somatic Whole Exome Sequencing. רק ריצוף מלא של כלל הגנים בגידול מבטיח כיסוי הרמטי של כל אפשריות הטיפול הקיימות כיום, ומגדיל את הסיכוי למציאת התאמה לטיפול מתאים, או התאמה לניסוי קליני.
בנוסף, ריצוף של כלל הגנים בגידול מאפשר אנליזה של כמות עצומה של מידע הנחוצה לקביעת מקור הגידול ותגובה לטיפולים שמשלבים כימותרפיות שונות.

ריצוף ה – RNA מאפשר לאמוד את רמות הביטוי של הגנים בגידול. בשיטה זו ניתן לדעת האם ואילו גנים הופעלו, ואילו גנים אחראים על השגשוג של הגידול. הכוונת הטיפול כנגד הגנים האחראים על שגשוג הגידול מגדילה באופן משמעותית את הסיכוי להצלחת הטיפול. חברת Caris בודקת את ביטוי כלל הגנים בגידול בשיטה הנקראת Whole Transcriptome Sequencing
בדיקת ה – RNA הוכחה כחיונית לאיתור מוטציות מסוג טרנסלוקציות – מוטציות אשר עליהן פועלים רוב הטיפולים הביולוגים היום. לפי קווי ההנחיה האמריקאים, ה – NCCN, תוספת ה – RNA הינה חשובה, ואף הפכה לבדיקת חובה בסוגי סרטן כגון סרטן ריאות מסוג תאים לא קטנים – NSCLC.

הגנים בגידול מהווים מתכון ליצירה של חלבונים. החלבונים הם המולקולות או המבנים המרכיבים את התא ואחראים על פעולתו. חלבונים הגורמים לפעילות סרטנית, כגון קולטנים להורמוני גדילה הפועלים ביתר, לדוגמא EGFR, או חלבונים המנטרלים את פעולת מערכת החיסון כגון PDL-1 מהווים מטרות טיפול אליהן נקשרות התרופות האנטי סרטניות. מכאן שמדידה ישירה של רמת ביטוי החלבונים היא בעלת חשיבות עצומה לניבוי הצלחתם של טיפולים כגון קיטרודה Keytruda)) או Opdivo.
לחברת Caris רפרטואר צביעות החלבונים הרחב ביותר כיום, לרבות צביעת ארבעה חלבונים הנקראים MMR המנבאים תגובה לאימנותרפיה, בנוסף לאנליזות TMB ו – MSI . תוספת צביעת ה – MMR לאנליזות PDL-1, MSI ו -TMB מגדילה את הסיכוי למציאת התאמה לטיפול אימונותרפי.

במקרים מסויימים, כמות החומר (ה DNA וה – RNA) בביופסיה נמוכה, ועלולה שלא להספיק לביצוע הבדיקה. לחברת – Caris פטנט יחודי – בעזרת לייזר מונחה תמונת מיקרוסקופ, נאספים תאי הגידול מתוך הביופסיה, וחלקם היחסי בדגימה מועשר, כך שהסיכוי לכשלון הבדיקה בשל מיעוט חומר בדגימה הוא נמוך ביותר, לעומת אחוז ניכר של כישלונות בביצוע הבדיקה, במחלות כמו סרטן ריאה, בבדיקות מתחרות.

ב – 5% מהגידולים, מקור הגידול הראשוני אינו ידוע. זיהוי מקור הגידול הכרחי למתן טיפול נכון עבור החולה. בדיקת – Caris משלבת את המידע העצום המתקבל מריצוף כלל הגנום הגידולי לכדי מתן אנליזה מדויקת של מקור הגידול. שיטת בדיקה זו מהווה פטנט ייחודי אשר פותח בשילוב עם בית החולים MD-Anderson בארה"ב, אחד מבתי החולים המובילים בעולם בטיפול בסרטן.